Wheeler adında ki gizli bir ajan görevde olduğu günlerden bir gece CIA tarafından kaçırılır. Kendine geldiğinde ise bir denizaltının hapishanesinde olduğunu görür. Burası CIA'nın kara bölgesidir ve çok gizli tutulmaktadır. Wheeler'in tek kurtuluş şansı ise Marco isimli adamla iş birliği yapmaktır. Black Water Filminin başrollerinde Jean-Claude Van Damme ve Dolph Lundgren gibi iki dev isim rol almaktadır.
